Cpd no. | (PDB ID: 4y72) | (PDB ID: 2ra3) | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S (energy binding score) (Kcal/mol) | RMSD | Distance (A) | Binding interaction | S (energy binding score) (Kcal/mol) | RMSD | Distance (A) | Binding interaction | |||||
Ligand | Receptor | Type | Ligand | Receptor | Type | |||||||
5 | − 7.9160 | 1.0834 | 3.03 | N-Amino | Asp 86 | H-donor | − 6.8706 | 0.9802 | 2.89 | O-Amide | Gly 193 | H-acceptor |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | 2.99 | O-Carbonyl | Lys 60 | H-acceptor |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | 4.64 | Benzene ring | Phe 41 | π–H |
8f | − 7.9504 | 1.3730 | 3.51 | N-Nitrile | Lys 130 | H-acceptor | − 7.2367 | 1.3140 | 3.57 | Cl-atom | Asp 189 | H-donor |
 |  |  | 3.88 | Benzene ring | Ile 10 | π–H |  |  | 4.06 | C-Benzene ring | His 57 | H–π |
 |  |  | 3.95 | Benzene ring | Glu 12 | π–H |  |  | 3.95 | Benzene ring | His 57 | π–H |
9d | − 8.1223 | 1.5557 | 3.17 | N-Amino | Gln 132 | H-donor | − 6.1324 | 1.2871 | 3.05 | N-Nitrile | Asn 34 | H-acceptor |
 |  |  | 2.94 | N-Amide | Ser 84 | H-donor |  |  | 3.68 | Benzene ring | Gly 38 | π–H |
 |  |  | 3.38 | N-Dimethylamino Benzene ring | Lys 130 | H-acceptor |  |  |  |  |  |  |
 |  |  | 4.16 |  | Gly 11 | π–H |  |  |  |  |  |  |
9f | − 8.0945 | 1.4239 | 4.06 | Benzene ring 6-benzene ring | Ile 10 | π–H | − 5.9004 | 0.9566 | 3.07 | N-Nitrile | Trp 237 | H-acceptor |
 |  |  | 4.45 | Benzene ring | Thr 14 | π–H |  |  | 3.64 | Benzene ring | Pro 92 | π–H |
 |  |  | 4.02 |  | Lys 130 | π–cation |  |  |  |  |  |  |
Dox | − 8.8931 | 1.4144 | 2.72 | O-Hydroxy | Asn 133 | H-donor | − 6.2060 | 1.4534 | 3.00 | N-Amino | Arg 96 | H-donor |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | 3.67 | Benzene ring | His 57 | π–H |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | 4.53 | Quninone ring | Gln 192 | π–H |